El Herbario de la FCA-UNR, inscripto en el Index Herbariorum, un registro internacional de colecciones botánicas, es uno de los pocos herbarios existentes con numerosas plantas de la Provincia de Santa Fe.

Desde su inicio en 1972 a la actualidad, ha logrado reunir unos 12.000 ejemplares, representados en 134 familias botánicas. Se han identificado y catalogado casi 9.000 ejemplares correspondientes a 1.500 especies. Esto representa la mayor parte de la flora de la provincia, convirtiendo a la colección en uno de los documentos más preciados de la naturaleza y biodiversidad de Santa Fe.

El herbario reúne también una colección de plantas del partido de Pergamino, que si se compara con la colección realizada a principios del siglo pasado por el profesor Lorenzo R. Parodi, constituye el único documento existente sobre la erosión de la biodiversidad botánica y las invasiones vegetales a la que está sometida la región pampeana.

Esta colección, administrada por las cátedras de Botánica y Ecología Vegetal, es además la base de importantes estudios florísticos desarrollados actualmente y ha servido en forma directa o indirecta a más de 60 publicaciones científicas y 10 tesis doctorales y de maestría.